Tóm tắt
Mục tiêu: Sử dụng kỹ thuật giải trình tự để phân tích các đột biến gen katG, rpoB ở những chủng vi khuẩn lao kháng INH, RIF phân lập tại Bệnh viện TW Huế.
Phương pháp: Kháng sinh đồ lao của 214 chủng MTB được thực hiện theo phương pháp tỷ lệ kinh điển. Giải trình tự để tìm đột biến ở 81 chủng vi khuẩn lao bao gồm: 12 chủng nhạy và 34 chủng kháng INH, 12 chủng nhạy và 23 chủng kháng RIF.
Kết quả
- Tỷ lệ kháng thuốc chống lao nói chung là 24,3%. Kết quả kháng sinh đổ cho thấy INH và STM có tỷ lệ kháng cao nhất là 18,2%, tiếp theo là RIF (11,2%) và thấp nhất là EMB (7,9%).
- Không phát hiện đột biến nào trên gen katG và rpoB của các chủng nhạy cảm với INH và RIF. Tỷ lệ đột biến trên gen katG của MTB kháng INH là 61,8%. Hầu hết đột biến được tìm thấy ở codon 315 (90,5%). Tỷ lệ đột biến trên gen rpoB của MTB kháng RIF là 86,9%. Phát hiện 15 vị trí codon có đột biến ở gen rpoB và hầu hết nằm ở các codon 531 (32.3%), 516 (16.1%), và 526 (12.9%). Tỷ lệ đột biến ở vùng 81-bp “hot spot" của gen rpoB là 67,7%. Hầu hết MTB kháng RIF cũng kháng với INH, vì vậy đột biến ở gen rpoB là tiêu chí chỉ ra vi khuẩn lao đa kháng thuốc (MDR-TB).
Kết luận: Phát hiện đột biến ở codon 315 của gen katG và vùng 81-bp “hot spot" của gen rpoB sẽ hữu ích cho việc phát hiện nhanh vi khuẩn lao kháng INH và RIF.
Tài liệu tham khảo
Bộ Y tế (2009), Tài liệu hướng dẫn chẩn đoán, điều trị và phòng lao, Hà Nội.
Nguyễn Thu Hà (2012), Nghiên cứu lâm sàng, cận lâm sàng, đột biến gen rpoB, katG và inhA của vi khuẩn trong lao phổi tái phát, Luận án tiến sỹ chuyên ngành Lao, Đại học Y Hà Nội.
Abdelaal Amina et al. (2009), "Genotypic Detection of Rifampicin and Isoniazid Resistant Mycobacterium tuberculosis Strains by DNA Sequencing: a Randomized Trial", Annals of Clinical Microbiology and Antimicrobials, Vol. 8, No. 4, pp. 1-8.
Aslan Gonul, Tezcan Seda et al. (2008), "Genotypic Analysis of Isoniazid and Rifampin Resistance in Drug-Resistant Clinical Mycobacterium tuberculosis Complex Isolates in Southern Turkey", Japanese journal of infectious diseases, Vol. 61, pp. 255-260.
Caws M., Duy Phan M., Tho Dau Q. et al. (2006), "Mutations Prevalent among Rifampin- and Isoniazid-Resistant Mycobacterium tuberculosis Isolates from a Hospital in Vietnam", Journal of Clinical Microbiology, Vol. 44, No. 7, pp. 2333-2337.
Guo Jian-Hua et al. (2008), "Molecular Characterization of Drug-Resistant Mycobacterium tuberculosis Isolates from Sichuan Province in China", Japanese Journal of Infectious Diseases, Vol. 61, pp. 264-268.
Huyen NT Mai et al (2010), "Validation of the GenoTypeR MTBDRplus assay for diagnosis of multidrug resistant tuberculosis in South Vietnam", BioMed Central Infectious Diseases, Vol. 10, pp. 1-8.
Jun-ichiro Sekiguchi et al. (2007), "Detection of Multidrug Resistance in M. tuberculosis", Journal of Clinical Microbiology, Vol. 45, No. 1, pp. 179-192.
Miguel Viveiros et al. (2005), "DirectApplication
of the INNO-LIPA Rif.TB Line-Probe Assay for Rapid Identification of M. tuberculosis Complex Strains and Detection of Rifampin Resistance in 360 Smear-Positive Respiratory Specimens from an Area of High Incidence of Multidrug-Resistant Tuberculosis", Jour of Clin. Microbio., Vol. 43, No. 9, pp. 4880-4884.
Minh N. N., Nguyen Van Bac, Nguyen Thai Son et al. (2012), "Molecular Characteristics of Rifampin- and Isoniazid-Resistant M. tuberculosis Strains Isolated in Vietnam", Journal of Clinical Microbiology, Vol. 50, No. 3, pp. 598-601.
Perdigão J., Macedo R. et al. (2010), "Tuberculosis drug-resistance in Lisbon, Portugal: a 6-year overview", Clinical Microbiology and Infection, Vol. 17, No. 9, pp. 1397-1402.
Rabia Johnson et al. (2006), "Drug Resistance in Mycobacterium tuberculosis", Current Issues in Molecular Biology, Vol. 8, pp. 97-112.
Santos Lorena Cristina (2012), "Review: The Molecular Basis. of Resistance in M. tuberculosis", Open Journal of Medical Microbiology, Vol. 2, pp. 24-36.
WHO (2008), Anti-Tuberculosis drug resistance in the world, Fourth Global Report. The WHO/ IUATLD Global Project on Anti-tuberculosis Drug Resistance Surveillance 2002-2007.
WHO (2014), Global tuberculosis report 2014. 16. Yang Song et al. (2011), "Rapid detection of rpoB and katG genes from the sputum of multidrug- resistant M. tuberculosis by polymerase chain reaction (PCR)-direct sequencing analysis", African Journal of Microbiology Research, Vol. 5, No. 26, pp. 4519-4523.
| Đã xuất bản | 01-01-2015 | |
| Toàn văn |
|
|
| Ngôn ngữ |
|
|
| Số tạp chí | Số 27 (2015) | |
| Phân mục | Nghiên cứu | |
| DOI | ||
| Từ khóa |
công trình này được cấp phép theo Creative Commons Attribution-phi thương mại-NoDerivatives 4.0 License International .
Bản quyền (c) 2015 Tạp chí Y học lâm sàng Bệnh viện Trung Ương Huế